倪瓚的繪畫開創了水墨山水的一代畫風，與黃公望、吳鎮、王蒙並稱"元代四大家"。畫法疏簡，格調天真幽淡，以淡泊取勝。作品多畫太湖一帶山水，構圖多取平遠之景，善畫枯木平遠、竹石茅舍，景物極簡。其畫多以幹筆皴擦，筆墨極簡，所謂"有意無意，若淡若疏"，形成荒疏蕭條一派。在元四家中，倪瓚在士大夫的心目中享譽極高。明何良俊雲："雲林書師大令，無－點塵土。"明代江南人以有無收藏他的畫而分雅俗。其繪畫實踐和理論觀點，對明清數百年畫壇有很大影響。被評為"中國古代十大畫家"之一，英國大不列顛百科全書將他列為世界文化名人。
倪瓚性情清高孤傲，個性迂癖，不事俗務，一生沒做過官。明人搜輯的《雲林遺事》中說，一次他留客住宿，夜裏聽到咳嗽聲，次日一早就命入仔細尋覓，有無痰跡。仆人找不到，假說痰吐在窗外梧桐樹葉上，他就叫趕快把葉剪下，丟在離家很遠的地方。倪瓚還有一傳說："吳王"張士誠之弟張士信，一次差人拿了畫絹請他作畫，並送了很多金錢。倪瓚大怒，撕絹退錢。不料，一日泛舟太湖，正遇到張，被痛打了一頓，倪瓚當時卻噤口不出一聲。事後有人問他，他答道："一出聲便俗"。倪瓚曾作一詩以述其懷："白眼視俗物，清言屈時英，富貴烏足道，所思垂令名。"